国鉄キハ40系気動車 ／ JR東日本

盛岡支社八戸運輸区　「盛ハヘ」
八戸線運用		2018年4月1日現在の配置は、キハ40形500番台23両、キハ48形500番台2両、1500番台4両が配置されていた。キハ48形1500番台のうち3両は「リゾートうみねこ」。一般形車両はキハE130系に置き換えられたため定期運用は無く、全車廃車予定。2018年3月16日まで、八戸線全線と青い森鉄道線（三戸 - 八戸間）で運用されていた。 2018年3月16日をもって定期運用終了。
秋田支社秋田車両センター　「秋アキ」
男鹿線運用		2018年4月1日現在の配置は、キハ40形500番台24両、1000番台1両、2000番台4両、計29両。500番台は五能線・男鹿線・津軽線で、1000番台・2000番台は男鹿線で運用。 キハ48形500番台15両、700番台4両、1500番台12両、1700番台1両、計32両。奥羽本線、五能線、津軽線で運用。キハ48形500番台4両、1500番台1両、計5両。546・549・550の3両はジョイフルトレイン「みのり」、547・1541の2両は「びゅうコースター風っこ」で、すべて波動用。 2021年3月12日をもって定期運用終了。
五能線・津軽線 運用
仙台支社郡山総合車両センター　「仙コリ」
只見線・磐越西線 運用		2018年4月1日現在の配置は、キハ40形500番台8両、2000番台5両で計13両。 会津若松派出所に常駐し、只見線および磐越西線会津若松 - 野沢間で運用。 2020年3月13日をもって定期運用終了。
新潟支社新津運輸区　「新ニツ」
羽越本線・只見線 ・磐越西線運用		2018年4月1日現在の配置車両は、キハ40形500番台5両、2000番台2両、計7両。キハ47形500番台12両、1500番台11両、計23両。キハ48形500番台6両、1500番台5両、計11両。うちキハ40型1両 (552)とキハ48形2両（558・1542）は越乃Shu*Kura編成。羽越本線（新津 - 酒田間）、信越本線（新潟−新津間）、磐越西線（新津−会津若松間）、只見線（小出−只見間）で運用。 2020年3月13日をもって定期運用終了。